A Long-Context Generative Foundation Model Deciphers RNA Design Principles
1 億 1400 万を超える全長 RNA 配列で学習した長文脈生成基盤モデル「EVA」は、多様な RNA 設計タスクにおいて既存手法を凌駕する性能を発揮し、RNA の設計原理の解明と機能性 RNA の創出を可能にします。
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molecular biology
204 件の論文
分子生物学は、命の仕組みを最小単位である分子レベルで解き明かす学問です。DNA からタンパク質まで、細胞がどのように動き、情報を伝え、生命活動を支えているのかを明らかにするこの分野は、現代医学やバイオテクノロジーの基盤となっています。
Gist.Science では、bioRxiv から投稿される分子生物学の最新プレプリントをすべて網羅的に収集し、専門家の手で解説しています。難解な専門用語を噛み砕いた平易な要約と、深い洞察が得られる技術的な詳細の両方を提供することで、研究者だけでなく広く科学に興味を持つ方々も最新の知見をすぐに取り込めるようにしています。
以下に、bioRxiv から新たに公開された分子生物学の論文リストを掲載します。最新の研究動向をぜひご覧ください。
GRASP: A PLANT TRANSFORMATION-INDEPENDENT CRISPR-BASED SYSTEM FOR AFFINITY PURIFICATION OF SPECIFIC CHROMATIN LOCI
本論文は、植物の特定の染色体領域を遺伝子組換えなしに直接抽出・分析可能にする、CRISPR-Cas9 技術を用いた新規かつ汎用性の高い手法「GRASP」を開発し、ブドウとトマトを用いた検証でその有効性を示したものである。
Spermidine enhances metabolic flexibility and attenuates inflammation associated with ageing in farmed Atlantic salmon
本論文は、養殖大西洋サーモンの老化に伴う代謝柔軟性の低下や炎症を、食事からのスペルジミン補給が脂肪組織の炎症を抑制し筋肉での脂肪酸代謝を改善することで軽減できることを実証し、サーモンが脊椎動物の代謝老化研究の新たなモデルとなり得ることを示しています。
Validation of a molecular workflow for Cochliomyia hominivorax (New World screwworm) identification in field samples
この論文は、米国への再侵入が懸念されるウシウジバエ（Cochliomyia hominivorax）の迅速かつ正確な同定を目的として、形態学的同定を補完・検証するためのリアルタイム PCR 法とサンガーシーケンシング法を組み合わせた分子ワークフローの開発と評価を行ったものである。
Digoxin Inhibits Bax{triangleup}2-induced Neuronal Cell Death
FDA 承認薬のスクリーニングにより、アルツハイマー病における Bax{Δ}2 誘発性神経細胞死をナノモル濃度で阻害する新規候補としてジゴキシンが特定されたが、その治療応用は毒性の課題を踏まえ、化学修飾や類似化合物の開発へと道を開くものとして位置づけられた。
The muscle atrophic phenotype of MuSK myasthenia gravis: Insights from a preclinical rat model
この研究は、MuSK 抗体陽性筋無力症のラットモデルを用いて、NMJ 障害を超えてミトコンドリアや翻訳ホメオスタシスの破綻が関与し、特に遅筋線維で顕著な筋萎縮とタンパク質組換えが引き起こされることを明らかにした。
Integrating Semi-Dwarf Traits into Diverse Wheat Landraces through CRISPR/Cas9, Base Editing and Prime Editing
本研究は、CRISPR/Cas9、塩基編集、プライム編集を用いて、多様な遺伝的資源を有するワトキンス小麦在来品種に半矮性形質を精密に導入する手法を実証し、持続可能な小麦育種と食料安全保障の基盤を築いたものである。
Cytoplasmic circular dsDNA is a key constituent of stress granules
この論文は、ストレス顆粒の核の核酸成分の過半数を占める環状二本鎖 DNA（eccDNA）が、ストレス応答におけるストレス顆粒の形成に不可欠な役割を果たしていることを明らかにしたものである。
Photocrosslinking Activity-Based Probes to Capture the Dynamics of Ubiquitin RING E3 Ligase Interactions
著者らは、光活性化架橋剤を修飾したユビキチンを用いた活性ベースプローブのワークフローを確立し、これにより RING 型 E3 リガーゼと E2-ユビキチン複合体の相互作用領域を同定し、既知の構造の検証および新規モデルの評価を可能にしました。
Sample-derived cDNA guides broad host RNA depletion for in vivo pathogen transcriptomics
この論文は、逆転写された宿主 RNA をガイドとして RNase H を用いて宿主 RNA を選択的に除去する新たな手法を開発し、生体内での病原体トランスクリプトーム解析における宿主 RNA の支配的な背景ノイズを大幅に低減し、細菌 rRNA の保存を通じて微生物複製や生存状態の定量的バイオマーカーとしての利用を可能にするとともに、シーケンシング深度の大幅な削減によって生体内トランスクリプトミクスの経済的・計算論的課題を解決したことを報告しています。