Mechanistic insight into the phosphorylation of ERK by MEK
本研究は、クライオ電子顕微鏡構造解析により、MEK1 が ERK1 のリン酸化を触媒する際にリン酸基を Y204 から T202 へ転移させるという意外なメカニズムと、MEK1 のリン酸化酵素活性およびリン酸酵素活性の両方を明らかにし、がん治療への新たな洞察を提供した。
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本研究は、クライオ電子顕微鏡構造解析により、MEK1 が ERK1 のリン酸化を触媒する際にリン酸基を Y204 から T202 へ転移させるという意外なメカニズムと、MEK1 のリン酸化酵素活性およびリン酸酵素活性の両方を明らかにし、がん治療への新たな洞察を提供した。
本論文は、脳器官モデルを用いた多角的解析により、神経発生における Copg2 の母性対立遺伝子偏倚が、MestXL による転写干渉のみではなく、神経前駆細胞における母性対立遺伝子の活性化と、その後ニューロン段階での MestXL 依存性の父性対立遺伝子抑制という、時間的・段階的な二段階メカニズムによって制御されていることを明らかにした。
本研究は、レーザーカプチャーマイクロディセクションと RNA シーケンシングを組み合わせ、造礁サンゴ(Pocillopora acuta)の口側組織と非口側組織における空間的に解像された遺伝子発現を解析し、それぞれの組織が環境感知・免疫応答や骨格形成など異なる機能に特化している一方で、多くの機能関連遺伝子が複数の組織で発現していることを明らかにし、サンゴのストレス応答メカニズムの解明には単一遺伝子ではなく多次元的な発現パターンやより高解像度な空間トランスクリプトミクス技術の必要性を強調しています。
この論文は、統合トランスクリプトミクスとプロテオミクスアプローチを用いてヒト卵管の繊毛関連タンパク質を高解像度で空間的にマッピングし、不妊症や関連疾患のメカニズム解明に貢献する包括的なプロファイルを提供したものである。
本研究は、CRISPR/Cas9、塩基編集、プライム編集を用いて、多様な遺伝的資源を有するワトキンス小麦在来品種に半矮性形質を精密に導入する手法を実証し、持続可能な小麦育種と食料安全保障の基盤を築いたものである。
本研究は、単細胞 RNA シーケンシングと蛍光ベースの多重免疫組織化学を組み合わせることで、精子形成における細胞状態の空間的マッピングを確立し、mRNA とタンパク質の発現動態の不一致(特に PIWIL4 の例)を明らかにし、健康および疾患における細胞動態の研究のための拡張可能な枠組みを提供した。
本論文は、バクテリオファージ T4 において、ORFan 遺伝子 5.4 がスパイク先端タンパク質をコードしており、ファージ粒子の組み立てには不要であるものの、宿主細胞の感染(特に短縮リポ多糖を持つ細菌への感染)および適応度に不可欠であることを明らかにしたものである。
本論文は、胚発生の進行を制御するために、Ewsr1b、Syncrip、HuR および 3'UTR の長さの違いが、受精卵における休眠 mRNA の翻訳を時空間的に調整する「波状」のメカニズムを解明したことを報告しています。
本研究では、マイクロ流体技術を用いた高スループット寿命解析法を開発し、酵母の配偶子形成によるリジュベネーション(若返り)に、ER 選択的オートファジー受容体である Atg39 と Atg40 が初めて関与することを明らかにしました。
本研究は、BAF 複合体の異なるサブユニット欠損細胞に対する多様な薬剤スクリーニングを行い、特定の BAF 欠損が MEK/EGFR 経路阻害剤への感受性やチェックポイント阻害剤への耐性といった特異的な依存性を示すことを明らかにし、BAF 複合体の構成とゲノム安定性および細胞増殖制御との関連を体系的に解明した。
この論文は、減数分裂においてトポイソメラーゼ Top3 が転写と共役してホリデイ junction の分岐移動を誘導し、SPO11 による切断部位からコヒーシン関連軸部位へと移動させることで、正確な染色体分配を確保する crossover 解決を制御することを明らかにしたものである。
本論文は、IWS1 の内在性無秩序領域に含まれる短配列モチーフが多価的に転写伸長複合体の構成因子と相互作用し、複合体の組織化や RECQL5 による抑制からの保護を通じて転写伸長を調節するモジュラーな足場タンパク質として機能することを、クライオ電子顕微鏡解析と機能アッセイにより実証したものである。
Homer1 EVH1 ドメインに存在する自閉症スペクトラム障害関連の M65I および S97L 変異は、全体構造や結合特性に大きな変化をもたらさないものの、ドメイン内部の秒からミリ秒時間スケールの動的挙動を乱し、特に M65I 変異では熱的安定性の低下も示唆されることを、実験的・計算論的アプローチにより明らかにした。
この論文は、神経マイクロエクソンのスプライシングが、配列保存性が高く構造的にアクセスしやすい「分岐点から 3' スプライス部位までの領域」の構造的特徴に依存しており、これが SRRM4 の結合やスプライソソームの組み立てを促進していることを、ヒトとニワトリの比較研究および実験的 RNA 構造解析を通じて明らかにしたものである。
本論文は、酵母の孤児セプチンが、C 末端ドメインを介したホモオリゴマー化と分解酵素 Hsp104 という二つの並行メカニズムによって保護され、セプチン複合体の厳密な化学量論的平衡と高次構造の安定性が維持されていることを明らかにしたものである。
本研究は、内胚葉由来の上皮と一次性間質細胞を含む二重チャネル型マイクロ流体プラットフォームを開発し、胚着床の初期段階における胚と子宮内膜の相互作用を再現・解析できる新たなモデルを確立したことを報告しています。
この研究は、エゾヤマネの脳皮質において、冬眠の各段階(特に入眠から後期冬眠、および後期冬眠から覚醒への移行)で代謝抑制や細胞保護に関わる特異的な転写プログラムが活性化され、覚醒時に急速に逆転する仕組みをRNAシーケンシングによって解明したものである。
本論文は、PCR 不要の標的ライブラリー調製法「Nicking Loop™」が、合成参照サンプルを用いた評価において、MGI の DNBSEQ™プラットフォームと Illumina MiSeq プラットフォームの両方で同等の高い性能を示すことを実証し、同手法がプラットフォーム非依存の標的シーケンシング戦略として有効であることを明らかにした。
本論文は、コイリンの C 末端領域が RG 反復配列による非特異的 RNA 結合と、Sm 蛋白に特異的に結合するチューダー様ドメインからなる二部構造モジュールを有しており、これらが成熟した snRNP と未成熟な snRNP を識別し、カール小体における未成熟複合体の隔離を分子レベルで説明することを明らかにしたものである。
ELP3 は、単一のコドン頻度ではなく、特定のダイコドン(E3dDCs)の配列文脈や翻訳開始活性を介して、前立腺癌細胞の増殖や細胞分裂に必要なタンパク質発現を調節し、その欠乏が癌細胞の増殖抑制を引き起こすことを明らかにしました。